La orientación del programa de Magister es demarcada en las líneas de investigación y desarrollo en las que el Departamento de Ingeniería Informática y Ciencias de Computación participa activamente, e impulsa nuevas áreas potenciales de investigación.
Se hace notar la importancia que adquiere en este programa la vinculación de la investigación con el desarrollo de aplicaciones reales, lo que lo convierte en una opción válida para aquellos profesionales con inquietud de perfeccionamiento a nivel de postgrado, pero sin intenciones de continuar una carrera académica.